Estudio de la interacción DNA-proteína de factores de transcripción tipo MADS-box de Fragaria vesca

Abstract

La frutilla silvestre (Fragaria vesca) es originaria de Europa y Asia, y en la actualidad se encuentra distribuida en casi todo el mundo. F. vesca ha sido ampliamente estudiada por su fácil manejo y reproducción, y porque su genoma está secuenciado, lo que la convierte en una especie representativa del género Fragaria. La frutilla en general presenta algunos problemas en postcosecha debido a la rápida pérdida de firmeza del fruto que se traduce en una corta vida de postcosecha. Esto se debe al rápido proceso de desensamblaje de la pared celular que ocurre en frutilla. Se cree que ciertos factores de transcripción estarían regulando la expresión de genes que codifican para enzimas encargadas de este proceso, al interactuar con secuencias CIS de sus respectivos promotores. En Fragaria se ha detectado un aumento de los factores de transcripción tipo MADS-box, en especial de la subfamilia SEPALLATA, durante el desarrollo y maduración de los frutos. Mediante un ensayo de ”Electrophoretic mobility shift assay (EMSA)” se pudo evidenciar que existe interacción directa entre los elementos en CIS del tipo RIN y SQM con las proteínas SEPALLATA1 (SDFvSEP1) y SEPALLATA3 (SDFvSEP3) de F. vesca. Por el contrario, no se encontró interacción entre elementos en CIS del tipo MYB con ninguno de los factores de transcripción en estudio. Esto sugiere que la interacción DNAproteína es específica. Palabras clave: MADS-box, interacción DNA-proteína, Fragaria vesca, SEPALLATA, RIN,MYB, SQUAMOSA./ABSTRACT: The wild strawberry (Fragaria vesca) is native to Europe and Asia, and is nowadays it has been distributed in almost the entire world. F. vesca has been widely studied due to its easy handling and reproduction, and in addition its genome is already sequenced, and therefore it is considered a representative species of the Fragaria genus. In general strawberry fruit has some postharvest problems which are due to the fast softening rate of the fruit that reduces its shelf-life. This is due to the fast cell wall disassembling that takes place in strawberry. It is believed that some transcription factors could regulate the expression of genes encoding for cell wall degrading enzymes involved in this process, by interacting with CIS regulatory elements in their promoters. In Fragaria it has detected an increase in MADS-box transcription factors, especially the subfamily SEPALLATA, during fruit development and ripening. Through an Electrophoretic mobility shift assay (EMSA) the direct interaction between CIS regulatory elements such as RIN and SQM with SEPALLATA1 (SDFvSEP1) and SEPALLATA3 (SDFvSEP3) proteins of F. vesca was demonstrated. By contrast, no interaction between CIS elements of the MYB type and the transcription factors under study was found. This suggests that the DNA-protein interaction is specific. Keywords: MADS-box, DNA-protein interaction, Fragaria